Diagnostica in vitro di biomarcatori per la medicina personalizzata in ambito oncologico basata su sequenziamento massivo parallelo di nuova generazione

Il progetto ha previsto lo sviluppo di Saggi NGS componibili mettendo a punto tecnologie e metodiche della fase cosiddetta library preparation, che consentano di caricare il sequenziatore con pool di librerie per target analitici diversi, massimizzando la capacità della corsa di sequenziamento e diminuendo i costi per test. Si è studiato inoltre come automatizzare i processi di progettazione e sviluppo incrementale, consentendo l’aggiunta di nuovi target in pannelli già validati.I partner sono intervenuti nell’ automazione software dell’aggiornamento dei dati di riferimento, riducendo al minimo la manual curation nel processo di aggiornamento delle fonti (database clinici e genetici, linee guida cliniche, studi clinici, pubblicazioni scientifiche). È stato sviluppato un sistema per l’aggiornamento di dati genici ricavati dalle pubblicazioni e forniti dagli utenti che possa essere consultato dai ricercatori. L’utilizzo dei dati presenti da parte degli utilizzatori finali viene tracciato tramite blockchain, con garanzia di integrità e inviolabilità data dalla registrazione delle operazioni sui dati. Ciò consente la protezione e la riservatezza dei dati clinici oltre a registrare il ricercatore che ha caricato i propri risultati.Nel progetto si è proceduto anche alla standardizzazione di protocolli in biopsia liquida, considerata la nuova frontiera per la tipizzazione e stadiazione del tumore senza procedimenti invasivi per il paziente.

Inizio: 02/08/2019
Fine: 19/07/2021